《明朝那些事儿》第二部，主要讲述了从建文帝到永乐年间二十六年的历史。
朱元璋病逝前，放心地将皇位传予皇太孙朱允炆，看似传承有序的大明江山酝酿起微妙的不安定因素。九位戍边藩王手握重兵，年少弱质的朱允炆时刻感受着威胁，开始削藩政策，燕王朱棣应声造反，由此挑动起长达四年的靖难之战。
朱允炆占尽天时、地利、人和，如何被逼得气数渐失、江山易手？朱棣从背着反贼的骂名负隅顽抗，到长驱直入、挥师入京，期间经历重重危机，多次奇迹般地死里逃生，难道果真有冥冥中的命中定数？方孝孺、铁铉、道衍……忠臣良将各显本色，造势谋臣挥斥方遒。
这场战争的影响也迟迟没有散去，建文旧臣被赶尽杀绝，而朱允炆生死不明的下落也成为一道千古迷题。但不论如何，朱棣开始了他的国君生涯，一手缔造了一个繁荣的朝代，一个众人仰视的伟大国家，大明！