《热带园艺植物病理学》全书共有7章，前4章为植物病理学通论，包括热带园艺植物病害的概念及症状、病原学、病害的发生与发展、病害的诊断与治理；后3章为热带园艺植物病理学各论，包括热带果树病害、热带蔬菜病害和热带观赏植物病害。对于次要的、偶发性病害或局部分布的病害，则在每章后面以表的形式列出，以便查阅检索。
《热带园艺植物病理学》还注重科学性、系统性和前沿性，菌物分类采用国际上权威的《菌物词典》第九版（2001）所述的分类系统，热带园艺植物病原菌物主要划分到原生动物界的根肿菌门；假菌界的卵菌门；菌物界的壶菌门、接合菌门、子囊茵门、担子菌门和半知茵类。原核生物的分类采用国际上权威的《伯杰氏系统细菌学手册》第二版（2007）所述的分类系统，原核生物不再分为薄壁菌门、厚壁菌门、柔壁菌门和疵壁菌门4个门，而是分成两个域：古生菌域和细菌域，下设25个门。热带园艺植物病原原核生物主要分布在细菌域的变形菌门、放线菌门和厚壁菌门中。植物病毒分类也引用了国际病毒分类委员会（ICTV）第八次报告（2005）的最新植物病毒分类系统。