柯南迷们注意了，我们又要一起去揭开重重迷雾，找到最后的答案了。他在听路人风言的耳语，他在看大人忽略的细节；他勇敢，那些危险险、诡异的案件在严密的推理之中，真相暴露与光天化日之下。他无奈最爱的人就在身边，却不知道他的真实身份。他是有史以来最年轻的名侦探；他是动漫界的传奇人物：他最爱说的一句话：真相只有一个!他就是——江户川柯南!
这部超人气的侦探漫画，以其引人入胜的剧情，错综复杂的人际关系及独特的描写视角征服了大批侦探迷的心。其剧场版更是年年票房榜上有名的大片，每一部都是相当轰动的大作。那么，就让我们随最新特别篇与柯南一同寻找真正的答案吧。今天我们要揭开的秘密是……小小的名侦探·江户川柯南的真实身份是高中生名侦探·工藤新一。
借住在女朋友·小兰家，也就是[毛利侦探事务所]里，一边追踪把自己的身体变成了小孩的黑衣组织，一边解决着无数的困难事件。
此时，柯南开始怀疑出入事务所的少年·本堂瑛祜和黑衣组织中的女子基尔一就是水无怜奈一之间有某种关系。
在调查本堂发现的不可思议的事件时，中途遇到了调查另一起杀人事件的高木警官他们。
柯南他们也赶往了案发现场，结果在那里和那时候遇到的一个男孩再次相见……？！